Le Segreterie di Stato corrispondono ai Ministeri italiani. Ciascun Segretario di Stato rappresenta il dicastero per il quale ha ricevuto l'incarico di governo, rispondendone individualmente davanti al Consiglio Grande e Generale. Di seguito le nove Segreterie di Stato, come da ultime elezioni politiche di novembre 2012:
• Segreteria di Stato per gli Affari Esteri e Politici;
• Segreteria di Stato per gli Affari Interni, Funzione Pubblica, Giustizia e Rapporti con le Giunte di Castello;
• Segreteria di Stato per le Finanze e Bilancio, Poste e Rapporti con l’ A.A.S.F.N.;
• Segreteria di Stato per l’istruzione, Cultura e Università, Ricerca Scientifica, Affari Sociali e Pari Opportunità;
• Segreteria di Stato per la Sanità e Sicurezza Sociale, Famiglia, Previdenza e Programmazione Economica;
• Segreteria di Stato per il Territorio e Ambiente, Agricoltura, Telecomunicazioni, Politiche Giovanili, Sport, Protezione Civile e Rapporti con l’A.A.S.L.P.;
• Segreteria di Stato per il Lavoro, Cooperazione e Informazione;
• Segreteria di Stato per l’Industria, Artigianato, Commercio, Trasporti e la Ricerca;
• Segreteria di Stato per il Turismo e i Rapporti con l’A.A.S.S. .